Quand les plantes, les champignons et les bact茅ries s鈥檜nissent pour d茅contaminer les sols pollu茅s
La capacit茅 de certaines esp猫ces d鈥檃rbres 脿 r茅habiliter des sites contamin茅s repose sur des interactions complexes entre leurs racines, les champignons et les bact茅ries du sol. Voil脿 ce qu鈥檜ne 茅tude men茅e par des experts en bio-informatique et en biologie v茅g茅tale de l鈥橴niversit茅 不良研究所 et de l鈥橴niversit茅 de Montr茅al vient de mettre en 茅vidence.
Certains arbres 脿 croissance rapide, tels les saules, sont connus pour tol茅rer et m锚me d茅contaminer des sols pollu茅s par des r茅sidus p茅troliers ou des m茅taux lourds. Ce processus de r茅habilitation des sols, la phytorem茅diation, est souvent associ茅 au m茅tabolisme secondaire, c鈥檈st-脿-dire la production de mol茅cules sp茅cialis茅es qui aident les plantes 脿 tol茅rer des stress environnementaux.
Les r茅cents r茅sultats obtenus par ces scientifiques montr茅alais et laissent supposer que des relations symbiotiques avec les microbes du sol sous-tendent la capacit茅 des saules 脿 cro卯tre dans cet environnement stressant. En utilisant des technologies de pointe permettant l鈥檃nalyse de l鈥檈xpression des g猫nes de plusieurs organismes simultan茅ment, les chercheurs ont 茅tudi茅 les racines de saules 脿 croissance rapide poussant sur un site contamin茅 dans la r茅gion montr茅alaise. Ils ont d茅couvert que la d茅gradation des hydrocarbures dans le sol serait le r茅sultat d鈥檌nteractions complexes entre diff茅rentes esp猫ces de champignons mycorhiziens (qui forment un r茅seau symbiotique avec les racines v茅g茅tales) et certaines bact茅ries.
芦听Nous abordons habituellement les travaux en g茅n茅tique en limitant la recherche 脿 un seul organisme ou 脿 un r猫gne 脿 la fois听禄, pr茅cise Emmanuel Gonzalez, auteur principal de l鈥櫭﹖ude et sp茅cialiste en bio-informatique au Centre canadien de g茅nomique computationnelle de l鈥橴niversit茅听不良研究所. 芦听Le plus 茅tonnant dans cette recherche a 茅t茅 de constater que l鈥櫭﹖ude de la g茅n茅tique des organismes vivants dans le sol a permis de brosser un portrait biologique plus pr茅cis. Ces r茅sultats portent 脿 croire que de telles interactions mutualistes complexes seraient la norme 脿 l鈥檈xt茅rieur des laboratoires.听禄
Nicholas听Brereton, attach茅 de recherche 脿 l鈥橧nstitut de recherche en biologie v茅g茅tale de l鈥橴niversit茅 de Montr茅al et auteur en chef de l鈥櫭﹖ude, ajoute听: 芦听Nous avons abord茅 l鈥櫭﹖ude en pr茅sumant qu鈥檌l 茅tait possible de mieux int茅grer la bio-informatique et la biologie afin de mettre en 茅vidence la diversit茅 des fonctions activ茅es dans un syst猫me racinaire stress茅. Cette d茅marche nous a rapidement permis d鈥檃pporter des am茅liorations techniques gr芒ce auxquelles nous avons pu observer l鈥檈xpression g茅nique dans plusieurs types d鈥檕rganismes, ce qui nous a permis de faire des avanc茅es importantes dans ce domaine de la biologie environnementale. Nous esp茅rons que ces r茅sultats pourront montrer la puissance d鈥檜ne collaboration interdisciplinaire afin de mieux comprendre la complexit茅 des interrelations du monde vivant听禄.
L鈥檃rticle intitul茅 芦听Trees, fungi and bacteria: tripartite metatranscriptomics of a root microbiome responding to soil contamination听禄, par E.听Gonzalez et coll., a 茅t茅 publi茅 dans la revue Microbiome le 21听mars 2018.
Cette 茅tude a 茅t茅 financ茅e par G茅nome听Canada, G茅nome听Qu茅bec, le Conseil de recherche en sciences naturelles et en g茅nie du Canada, BioFuelNet Canada et les R茅seaux de centres d鈥檈xcellence du Canada.
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De nouvelles donn茅es g茅n茅tiques laissent supposer que les saules seraient en mesure de tol茅rer la pollution par l鈥檃pport en sucres qu鈥檌ls fournissent aux champignons mycorhiziens environnant leurs racines, et qu鈥櫭� leur tour, les champignons procurent des nutriments aux bact茅ries qui d茅gradent les hydrocarbures.
IMAGE听: Image de champignons ectomycorhiziens, par Hugues听Massicotte, professeur en 茅cologie et gestion foresti猫res 脿 l鈥橴niversit茅 du Nord de la Colombie-Britannique
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Nicholas Brereton
Universit茅 de Montr茅al, l鈥橧nstitut de recherche en biologie v茅g茅tale
nicholas.brereton [at] umontreal.ca
Emmanuel Gonzalez
Centre canadien de g茅nomique computationnelle
Centre d'innovation G茅nome Qu茅bec et Universit茅 不良研究所
emmanuel.gonzalez [at] mcgill.ca
Chris Chipello
Universit茅 不良研究所, Relations avec les m茅dias
514-398-4201
christopher.chipello [at] mcgill.ca
Jeff Heinrich
Universit茅 de Montr茅al, Relations avec les m茅dias
514 343-7593
jeff.heinrich [at] umontreal.ca
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